2023年11月，北京大学启动新一期“北京大学博雅人才共育基地”（简称“博雅共育基地”）遴选工作，通过多轮综合评审，重庆南开中学成功入选北京大学博雅人才四星级共育基地，此为本轮最高星级，学校申报的数学、化学、生物、信息四个学科全部入围！

北京大学博雅人才共育基地通过与“基地校”开展全方位的人才共育实践，实行“一体两翼”的合作方式，即以“博雅基地”为平台，从高质量的学科能力培养和全面的综合素质培养两方面，共同培育拔尖创新人才。双方通过学科共建等方式实现大学与中学人才培养的深度融通，持续激发学生的学习动力和创新精神，鼓励更多有理想、有天赋、有志趣的学生投身基础学科，从而为国家重大战略发展领域提供优秀的后备军。

重庆南开中学连续两次成功入选博雅人才共育基地！2021年4月，学校被北京大学授予首批“博雅人才共育基地”。